Bauskas pils muzeja krājums izveidots 1990. gadā, nodalot no Bauskas novadpētniecības un mākslas muzeja ar pili saistīto priekšmetu daļu. Tas tiek regulāri papildināts ar pētniecībā iegūtiem materiāliem, dāvinājumiem un mērķtiecīgi iegādātiem eksponātiem pils ekspozīciju veidošanai.
Krājuma mērķis ir saglabāt nākamajām paaudzēm Bauskas pils izpētē atklātos artefaktus, kā arī veidot 15.–17. gs. kultūru, sadzīvi un kara mākslu raksturojošas kolekcijas muzeja pētnieciskajam un izglītojošajam darbam.
Tematiski krājums atspoguļo Bauskas pili, tās apkārtni un ar to saistītās vēsturiskās personas, vienlaikus sniedzot ieskatu 15.–17. gs. arhitektūras, mākslas, sadzīves, amatniecības un kara mākslas attīstībā. Muzeja krājums ir sistematizēts vairākās tematiskajās kolekcijās:
Būvdetaļu kolekcija
Ietver arheoloģiskajos izrakumos iegūtus materiālus, kas raksturo 15.–17. gs. celtniecības procesus pilī: dažādu tipu ķieģeļus, dakstiņus, grīdas flīzes, apmetuma fragmentus un kaļķa javas paraugus.
Akmens kalumu kolekcija
Sastāv no 16. gs. beigu akmens rotājumu fragmentiem. Šī kolekcija ir unikāla manierisma laikmeta liecība, kas akcentē Bauskas pili kā nozīmīgu un reprezentatīvu Kurzemes-Zemgales hercogu rezidenci.
Dekoratīvās krāšņu keramikas kolekcija
Pārstāvēti vēlīnās gotikas, renesanses, manierisma un agrīnā baroka stila podiņi (15. gs. vidus – 18. gs. sākums). Sistematizējot krāsns podiņus un to fragmentus, ir izstrādāta detalizēta to tipoloģija un 2025. gadā izdots kolekcijas katalogs.
Arheoloģijas kolekcija
Apkopoti izrakumos laika posmā no 20. gs. 60. gadiem līdz mūsdienām iegūtie priekšmeti. Kolekcijā ietilpst sadzīves priekšmeti (aksesuāri, mēbeļu apkalumi, pīpju fragmenti) un militārie artefakti (lodes, kartečas, muskešu detaļas), kas apliecina pils aizsardzības funkciju. Senākais kolekcijas priekšmets ir vēlā paleolīta – agrā mezolīta krama kasīklis (8.–9. g.t.p.Kr.).
Ieroču kolekcija
Ietver Kurzemes-Zemgales hercogistē lietotos 17.–18. gs. čuguna lielgabalus un mortīras, kā arī laikmetam raksturīgos ugunsieročus (pistoles ar rata un krama aizdedzes mehānismiem, muskete, arkebūza, u.c.), aukstos ieročus (zobeni, kaujas āmurs, „morgenšteins”, u.c.) un kara aprīkojumu (pulvernīcas, ložu lejamās stangas, bruņas u.c.).
Lietišķās mākslas priekšmetu kolekcija
Sastāv no oriģināliem 16.–17. gs. interjera priekšmetiem: mēbelēm, gaismekļiem, traukiem un tekstīlijām, kas mērķtiecīgi iegādāti pils vēsturiskās vides rekonstrukcijai.
Numismātikas kolekcija
Veido 14.–17. gs. monētas (galvenokārt Rīgas un Livonijas kaltuvēs kaltie šiliņi), kas iegūtas izrakumos vai pirkumu ceļā.
Iespieddarbu kolekcija
Ietver 17.–19. gs. grāmatas un kartes, kā arī 20. gs. pastkartes ar pilsdrupu skatiem.
Tēlojošās mākslas kolekcija
Apkopoti glezniecības un grafikas darbi, kuros attēlotas Bauskas pilsdrupas. Kolekciju papildina hercogu Ketleru dzimtas portretu kopijas un 17. gs. Rietumeiropas mākslinieku oriģināldarbi.
Fotogrāfiju, fotonegatīvu un diapozitīvu kolekcijas
Dokumentē pilsdrupu stāvokli, arheoloģisko izpēti un restaurācijas gaitu (20. gs. sākums – mūsdienas). Īpaša vērtība ir fotogrāfu Ž. Ruķera un K. Grīnberga 20. gs. 20.–30. gadu stikla plašu negatīviem.
